Metody molekularne w ekologii i ochronie przyrody WF-OB-MOL
Prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej.
Wykład:
1. Czym zajmuje się ekologia molekularna. Podstawowe pojęcia z zakresu genetyki i ekologii molekularnej.
2. Źródła DNA i metody pobierania prób, izolacja DNA
3. Techniki molekularne i markery molekularne stosowane w ekologii i ochronie przyrody
4 – 6. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii populacyjnej (pokrewieństwo genetyczne między osobnikami, struktura genetyczna populacji i przepływ genów)
7 – 9. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ekologii behawioralnej (systemy rozrodcze, zmienność proporcji płci, badanie migracji)
10 – 14. Przykładowe zastosowania technik molekularnych w ochronie przyrody (wielkość populacji, zmienność genetyczna, inbred, maksymalizowanie zmienności genetycznej, banki różnorodności genetycznej, filogeografia).
15. Podsumowanie zajęć. Test końcowy z prezentowanych zagadnień (termin zerowy)
Ćwiczenia:
1. Zasady BHP, zapoznanie się z urządzeniami i zasadami pracy w pracowni
2-3. Izolacja DNA z krwi i innych tkanek (różne metody), określanie jakości i ilości wyizolowanego DNA (obsługa spektofotometru)
4-5. Techniki określania płci ptaków – przygotowanie PCR, zasada działania i obsługa termocyklera
6. Elektroforeza DNA i wizualizacja produktów elektroforezy
7. Podsumowanie uzyskanych wyników i dyskusja
W cyklu 2021/22_L:
Wykład: Ćwiczenia |
W cyklu 2022/23_L:
Wykład: Ćwiczenia |
W cyklu 2023/24_L:
Wykład: Ćwiczenia |
W cyklu 2024/25_L:
Przedmiot prezentuje metody pobierania i przechowywania prób do badań molekularnych. Przedstawia najważniejsze markery molekularne i ich zastosowanie w badaniach ekologicznych i dotyczących ochrony przyrody. Zapoznaje z podstawowymi technikami stosowanymi w ekologii molekularnej. Wykład: Ćwiczenia |
Dyscyplina naukowa, do której odnoszą się efekty uczenia się
E-Learning
Grupa przedmiotów ogólnouczenianych
Opis nakładu pracy studenta w ECTS
Poziom przedmiotu
Symbol/Symbole kierunkowe efektów uczenia się
Typ przedmiotu
Wymagania wstępne
Koordynatorzy przedmiotu
Efekty kształcenia
a) Efekty kształcenia
1. Wiedza:
EK1 Student zna metody badawcze z ekologii molekularnej i ich zastosowanie w ekologii i ochronie przyrody, opisuje i identyfikuje rodzaje technik molekularnych i markerów; definiuje pojęcia z zakresu podstaw genetyki i ekologii molekularnej
EK2 Student rozpoznaje podstawowe terminy w języku obcym (j. angielski) w zakresie metod molekularnych zastosowanych w ekologii i ochronie przyrody
2. Umiejętności:
EK3 Student potrafi wykonać proste zadania w dziedzinie badań molekularnych i bezpiecznie posługuje się urządzeniami w laboratorium
EK 4 Student posługuje się specjalistyczną terminologią w zakresie ekologii molekularnej i ochrony przyrody
3. Kompetencje:
EK5 Student rozszerza i doskonali swoje umiejętności zawodowe w zakresie metod badawczych w laboratorium
EK6 Student dba o rzetelność i wiarygodność swojej pracy w laboratorium
Kryteria oceniania
Ćwiczenia:
średnia ocena z 3 wejściówek dotyczących ćwiczeń (5 pytań jednokrotnego wyboru/otwartych).
3 prawidłowe odpowiedzi - 3
4 prawidłowe odpowiedzi - 4
5 prawidłowych odpowiedzi - 5
Oceniane będzie z stosowania się do zasad BHP podczas zajęć. Dopuszczalna 1 nieobecność na zajęciach (usprawiedliwiona lub nieusprawiedliwiona).
Wykład:
Ocena z prezentacji artykułu związanego z tematem (sposób prezentacji, umiejętność wyszukania odpowiedniego materiału do prezentacji) – 50% oceny końcowej
Ocena z testu końcowego – 50% oceny końcowej
Test wiedzy - głównie pytania jednokrotnego wyboru, także pytania dotyczące prezentacji
Suma punktów z testu powyżej 55 % zalicza przedmiot.
od 55,1% - dst
od 65,1% - dst+
od 70,1% - db
od 80,1% - db+
od 85,1% - bdb
Warunkiem przystąpienia do egzaminu jest zaliczenie ćwiczeń, wygłoszenie i zaliczenie prezentacji artykułu oraz obecność na przynajmniej połowie wykładów.
Obecność na wykładzie będzie sprawdzana.
Dalsze szczegółowe kryteria oceniania zostaną podane uczestnikom w trakcie zajęć.
Literatura
Wybrane rozdziały z:
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa
2. M. Pilot, R. Rutkowski, A. Malewska, T. Malewski 2005. Zastosowanie metod molekularnych w badaniach ekologicznych. Muzeum i Instytut Zoologii PAN, Warszawa
Literatura uzupełniająca:
1. P. C. Winter, G.I. Hickey, H.L. Fletcher 2006. Krótkie wykłady. Genetyka. PWN, Warszawa
2. P. C. Turner, A.G. McLennan, A.D. Bates, M.R.H. White 2007. Krótkie wykłady. Biologia molekularna. PWN, Warszawa
3. J. C. Avise 2004. Markery molekularne, historia naturalna i ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa
4. D. J. Futuyma 2005. Ewolucja. Wydawnictwo Uniwersytetu Warszawskiego, Warszawa
Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu
W cyklu 2021/22_L:
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa Literatura uzupełniająca: Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu |
W cyklu 2022/23_L:
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa Literatura uzupełniająca: Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu |
W cyklu 2023/24_L:
1. J. R. Freeland 2008. Ekologia molekularna. PWN, Warszawa Literatura uzupełniająca: Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu |
W cyklu 2024/25_L:
Wybrane rozdziały z: Literatura uzupełniająca: Artykuły w języku angielskim z zakresu ekologii molekularnej (zastosowanie metod w ekologii i ochronie przyrody) – podane przez wykładowcę w trakcie wykładu |
Uwagi
W cyklu 2021/22_L:
znajomość podstaw zoologii, ekologii, biochemii i genetyki oraz bierna znajomość języka angielskiego |
Więcej informacji
Więcej informacji o poziomie przedmiotu, roku studiów (i/lub semestrze) w którym się odbywa, o rodzaju i liczbie godzin zajęć - szukaj w planach studiów odpowiednich programów. Ten przedmiot jest związany z programami:
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: